在临床中常常发现鸡群的粪便不正常，除去季节性腹泻外还有病理性的腹泻，尤其是蛋鸡腹泻现在尤为突出。一般我们鸡的小肠粪便呈弯曲圆柱形状，粪便外表覆盖有一层深色带白色的尿酸盐。盲肠粪便成棕色糊状，偶也可见混有尿酸盐。当这两种粪便出现不正常时即预示着某种疾病即将发生。
1：绿色稀便：多见于急性新城疫，传染性喉气管炎，急性伤寒等疾病等 急性新城疫：粪便典型的绿色稀便。倒提发病鸡只从嗉囊流出粘液物，病鸡站立不稳，不愿意走动，解剖可见腺胃乳头出血，腺胃和肌胃交界处出血，小肠和盲肠扁桃体出血等症状。
喉气管炎：鸡群拉绿便外，鸡群发病鸡只咳嗽，咳出带血粘液，解剖可见喉头、气管黏膜有弥漫性出血。
急性伤寒：不仅拉绿便还拉白色稀便，外观可见发病鸡只呈企鹅姿势，解剖主要病变在肝部，肝脏肿大而且发红。
2：伴有饲主料的粪便：一般多见于球虫病恢复后期。坏死性肠炎，更换饲料等等在
球虫后期：解剖可见球虫处于恢复期，但肠道由于球虫的破坏，肠道对饲料不能充分吸收造成的，随着球虫病的恢复，肠道黏膜逐渐修复正常而改变正常。
坏死性肠炎：由于肠黏膜大量脱落而造成的
更换饲料：主要是由于饲料的更换造成的应激，一段时间过后即可恢复正常
3：白色稀便：常见于雏鸡白痢，急性霍乱，慢性副伤寒，传染性法氏囊，痛风，大肠杆菌病等。
雏鸡白痢：多见于进雏后的7日龄内，可见白糊状粪便粘结在肛门的周围。剖检可见卵黄吸收不全，肝脏表面有白色坏死小点。
急性霍乱：临床上出现呼吸困难，口流粘液。剖检可见肝脏肿大，肝脏表面有白色坏死点，心冠脂有出血点，卵黄蒂以上的小肠段出血。纵观全身黏膜有出血症状。
传染性法氏囊：粪便水样白色稀便，有啄肛现象，鸡只萎靡不振，蹲伏。剖检可见法氏囊肿大出血，病重鸡只法氏囊呈紫色葡萄样
大肠杆菌：该病是条件致病菌，多是继发性疾病。由于症状和其他疾病类似容易误诊。剖检可见铜绿色，肝脏有针尖大小不等的白色坏死点，肠道出血
痛风病：拉水样白色稀便。关节型痛风可见关节肿胀，内脏型痛风剖检可见内脏表面有白色尿酸盐沉积，一般多是饲料蛋白过高或者蛋白营养代谢障碍造成的。
4：血便：临床中一经发现首先怀疑是盲肠球虫，目前饲料原料质量不过关，常被霉菌污染，黄曲霉菌中毒也可引起。
盲肠球虫病：剖检可见盲肠肿胀，内含血便是本病的特征。
黄曲霉菌毒素中毒：主要是饲喂发霉饲料感染黄曲霉菌毒素污染造成的。剖检可见肝脏发黄并有出血斑。
5：水样粪便：此类情况多见于食盐中毒，疾病多见于肾型传支，雏鸡副伤寒。
食盐中毒：食盐中毒的鸡只可见转圈、抽搐、死亡快的症状。拉稀的时候伴有饮水欲望急增的现象
肾型传支：患此病的鸡只萎靡不振，拉白色水样粪便，饮水量急增，剖检可见肾脏呈花瓣样，大花肾脏，其他脏器没明显变化。
雏鸡副伤寒：该病感染鸡只时先期为粘稠样，后期呈水样，在肛门周围有粪便污染。剖检可见肝脏淤血，肝脏肿大，盲肠内有干酪物，小肠部位有出血等症状。